Aplikasi harus mudah diatur. Ini memerlukan instruksi untuk instalasi awal serta untuk setiap peningkatan yang dilakukan untuk tujuan keamanan. Dukungan yang mungkin diperlukan selama instalasi atau selama pengoperasian aplikasi harus disediakan oleh vendor. Ini dapat berkisar dari dukungan online hingga pertanyaan melalui telepon. Kemudahan penggunaan harus ditunjukkan dari antarmuka interaktif yang memiliki ikon yang digambar untuk menunjukkan pekerjaan yang dilakukannya.
Integrasi adalah fitur lain yang membuat solusi akuntansi penggajian menjadi penting untuk bisnis. Informasi kontak dapat diambil dari sistem pencatatan karyawan, rekening bank dapat diintegrasikan untuk menyetor gaji (atau upah) ke rekening karyawan berdasarkan total jam kerja dan setiap lowongan yang akan datang dapat diketahui sebelumnya. Sedangkan jam kerja juga dihitung dengan menilai waktu masuk dan keluar yang dimasukkan oleh karyawan itu sendiri. Manajemen harus memasukkan ketentuan mengenai karyawan seperti ketentuan liburan, cuti dan asuransi. Perhitungan dari data mentah dilakukan oleh aplikasi itu sendiri. Upaya yang dilakukan manajemen dalam perhitungan penggajian terlihat berkurang drastis.
Pengajuan akhir tahun untuk keperluan pajak juga dilakukan oleh aplikasi setelah tarif yang mempengaruhi bisnis dimasukkan oleh manajemen. Berbagai kontribusi oleh pemberi kerja serta pemotongan dari rekening karyawan. Pajak jaminan sosial, pajak pengangguran federal, asuransi pengangguran negara bagian, dll. Tarif berubah setiap tahun dan oleh karena itu aplikasi harus memperbarui tarif sehingga kepatuhan terhadap hukum dibuat. Selanjutnya, bisnis mungkin memiliki cabang di negara bagian yang berbeda dengan tarifnya sendiri yang harus diperhitungkan oleh aplikasi.
Pengingat adalah fitur lain yang meminta manajemen untuk melakukan pembayaran. Selain itu, aplikasi dapat secara otomatis mentransfer dana ke rekening negara tepat waktu, sehingga mengurangi upaya pengelolaan yang diperlukan untuk tujuan itu. Personel yang baru direkrut juga harus dilaporkan ke pemerintah.
Aplikasi penggajian juga harus memiliki ketentuan untuk 1099 pekerja kontrak sehingga karyawan dan konsultan dibedakan. Ini menghindari bisnis masuk ke penipuan penggajian. Sementara langkah-langkah pengendalian internal harus dipasang oleh manajemen, itu harus dilengkapi dengan aplikasi.
Data mentah serta data yang diproses harus dienkripsi dengan cara terbaik untuk memastikan perlindungan dari gangguan yang tidak diinginkan. Pencadangan data secara online memastikan bahwa bencana alam tidak akan menghambat data.